Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTX2P32243 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTX2P32243 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTX2P32243 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OTX2P32243 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTX2P32243 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTX2P32243 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTX2P32243 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTX2P32243 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
OTX2P32243 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
OTX2P32243 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
OTX2P32243 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
OTX2P32243 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
OTX2P32243 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
OTX2P32243 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTX2P32243 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms