Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKARP32238 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms