Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms