Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRBP28702 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRBP28702 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRBP28702 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRBP28702 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRBP28702 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRBP28702 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRBP28702 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRBP28702 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRBP28702 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRBP28702 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRBP28702 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRBP28702 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRBP28702 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRBP28702 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190 ms