Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms