Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP3P12645 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP3P12645 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP3P12645 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BMP3P12645 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BMP3P12645 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BMP3P12645 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BMP3P12645 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP3P12645 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms