Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRFP10586 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRFP10586 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms