Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXC4P09017 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC4P09017 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC4P09017 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC4P09017 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC4P09017 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC4P09017 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC4P09017 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC4P09017 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC4P09017 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC4P09017 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms