Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PKHD1P08F94 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PKHD1P08F94 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PKHD1P08F94 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PKHD1P08F94 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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