Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOP08100 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOP08100 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOP08100 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOP08100 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms