Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms