Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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