Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX6O95475 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX6O95475 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms