Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFL1O94874 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFL1O94874 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFL1O94874 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms