Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPM2O94759 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPM2O94759 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms