Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCP1A6NGW2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms