Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms