Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFG3L2Q9Y4W6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms