Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALKQ9UM73 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms