Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms