Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms