Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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HOXC10Q9NYD6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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