Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRN4Q9NRL3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms