Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms