Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms