Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms