Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms