Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms