Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms