Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms