Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms