Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms