Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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