Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms