Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
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GTF3C6Q969F1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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GTF3C6Q969F1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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GTF3C6Q969F1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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GTF3C6Q969F1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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