Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H3F3CQ6NXT2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms