Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms