Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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