Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms