Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms