Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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