Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABEP1Q15276 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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