Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCM1Q15154 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCM1Q15154 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCM1Q15154 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCM1Q15154 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PCM1Q15154 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCM1Q15154 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCM1Q15154 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PCM1Q15154 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCM1Q15154 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PCM1Q15154 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCM1Q15154 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PCM1Q15154 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PCM1Q15154 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCM1Q15154 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms