Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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