Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EEA1Q15075 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
EEA1Q15075 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EEA1Q15075 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EEA1Q15075 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EEA1Q15075 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EEA1Q15075 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EEA1Q15075 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
EEA1Q15075 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms