Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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BRD3Q15059 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
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BRD3Q15059 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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