Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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