Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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