Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms