Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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